被我们加热的材料如果是由极性分子组成，在电磁场作用下，这些极性分子由原来的随机分布状态转向依照电磁场的极性排列。而这种排列在高频电磁场作用下，将按交变电磁场的频率不断变化，工业微波加热过程造成分子的运动和相互摩擦从而产生热量。此时交变电场的场能转化为介质内的热能，使介质温度不断升高，这就是对微波加热***通俗的解释。
常规加热（如火焰、热风、电热、蒸汽等）都是利用热传导、对流、热辐射将热量首先传递给被加热物的表面，再通过热传导逐步使中心温度升高。它要使中心部位达到所需的温度，需要一些的热传导时间，微波加热则是电磁能直接作用于介质分子转换成热能，微波的透射性使介质内外同时加热，称为内部加热方式。
工业微波加热设备穿透性加热，加热速度快，均匀加热。其穿透的距离，在理论上与电磁波波长同数量级。因此工业微波加热使物体成份保持不变。微波加热是使用使被加热的物体本身成为发热物体，称之为整体加热方式，不需要热传导的过程，因此能在短时间内达到均匀加热。工业微波加热的时候物体各部位不论形状是什么样，通常都能够均匀的渗透电磁波，以产生热量，因此介质材料加热的无效性大大改善。微波加热与高频加热相比不需要重新设计适合物形状的电极，所发不论何种开头的物体都能做到均匀加热，这一点对提高产品质量很有利。
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