营养口服液微波灭菌设备是对物料内外同时进行加热，内部温度高，热传导是由内向外的，升温均匀而加热迅速，时间较短，如采用微波灭菌，可使(1)大肠杆菌和枯草杆菌在微波场中只要加温至70℃，保持2 min就能被全部杀死；(2)湿热枯草脂肪杆菌，在微波场中，温度70℃，保持2min，即被杀死。用15kW的隧道式小型微波设备进行灭菌，50s可杀灭细菌，18kW微波设备35s可杀灭细菌。（南京金佰力微波设备有限公司）
口服溶液剂微波灭菌试验：含菌量高达350万个大肠杆菌的口服溶液，密封在1～2 ml的安瓿中，经3～5kW功率，2450 MHz的微波作用15 s以上，安瓿温度接近110℃左右时，可将细胞细菌全部杀灭。金黄色葡萄球菌于此结果近似。枯草杆菌芽胞，含量为6万～8万个，液温必须达到140℃，保持20s以上才能彻底杀灭。含2 000～3 000个青菌胞子的口服溶液，在3～4kW微波功率作用下，液温达到120℃以上，经20～23s，即彻底杀灭。
对口服液有效成分的影响程度，据国外文献报道，用微波杀菌，药品的有效成分不会分解，用传统的方法杀菌，药品的有效成分分解显著。国内某制药厂用几个样品进行了对比试验，结果和文献报道完全一样。
营养口服液杀菌设备的特点：（南京金佰力微波设备有限公司）
1.微波杀菌设备是利用微波热效应和生物效应共同作用，改变细胞膜的通透性能，影响细菌生长发育直至死亡。
2.微波杀菌机采用热箱固定瞬间加热方式，节省能源。
3.占地面积小，食品杀菌机体小巧，节省环境。
4.便于控制，实现自动化袋装杀菌，处理设备操作简单，没有热惯性，能根据不同瓶装口服液工艺规范要求进行处理，减少专业生产操作人员，降低生产成本。
5.时间短，速度快。
6.微波杀菌设备加热除菌均匀彻底。

微波杀菌设备还可以应用于果酒饮料等液体杀菌